Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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