Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms