Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms