Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms