Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Olfr1234-201ENSMUST00000099783 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Sec61bQ9CQS8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sec61bQ9CQS8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms