Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccer1Q9CQL2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccer1Q9CQL2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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