Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znhit3Q9CQK1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms