Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RTRAFQ9CQE8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RTRAFQ9CQE8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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