Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pole4Q9CQ36 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pole4Q9CQ36 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Pole4Q9CQ36 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pole4Q9CQ36 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms