Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms