Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl43Q99N89 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms