Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac9Q99N13 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms