Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1b4Q99ME6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms