Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprtQ99M80 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms