Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdpd3Q99LY2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdpd3Q99LY2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms