Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp5lQ99LH9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms