Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf19Q99KP6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prpf19Q99KP6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms