Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms