Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps4Q99KG7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms