Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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TrabdQ99JY4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrabdQ99JY4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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