Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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