Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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