Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Smim11aQ99J19 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim11aQ99J19 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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