Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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Cldn16Q925N4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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