Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip1Q922J3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms