Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf6Q91YR7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms