Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms