Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rprd1aQ8VDS4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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