Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms