Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam20bQ8VCS3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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