Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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