Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl47Q8K2Y7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Mrpl47Q8K2Y7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl47Q8K2Y7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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