Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Brd3Q8K2F0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms