Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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