Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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