Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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