Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Slfn5Q8CBA2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slfn5Q8CBA2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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