Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4aQ8C9S8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms