Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms