Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc187Q8C5V8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc187Q8C5V8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc187Q8C5V8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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