Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rbbp5Q8BX09 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms