Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pggt1bQ8BUY9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms