Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep55Q8BT07 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms