Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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