Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc50Q810U5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms