Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms