Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Amigo1Q80ZD8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Amigo1Q80ZD8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Amigo1Q80ZD8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Amigo1Q80ZD8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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