Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube3cQ80U95 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms