Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp8Q80U87 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp8Q80U87 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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