Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Actn1Q7TPR4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms